Une fois lenregistrement de la marque international envoyé aux pays concernés, la validité de la marque sera examinée par linstance denregistrement de la marque du pays concerné. Linstance étrangère vérifiera la conformité de la marque internationale vis-à-vis des exigences de droit interne. En cas dobjections par cette instance ou doppositions par des tiers, linstance a le droit de ne pas accorder de protection à la marque internationale sur son territoire. Ce refus daccorder la protection au titre du droit des marques est appelé refus provisoire. Ce refus provisoire est notifié au Bureau International par linstance étrangère dans un délai de douze mois pour les Etats membres de lArrangement de Madrid et dans un délai de dix-huit mois pour les Etats membres du Protocole. Ce refus est publié par le Bureau International. En cas de refus de linstance, le demandeur peut toujours exercer les voies de recours adéquates (réexamen, recours, réponse à une opposition), devant linstance nationale étrangère. Une fois ces voies de recours épuisées, linstance doit informer lOMPI de lissue des recours : soit la confirmation, soit le retrait du refus. LOMPI publie la décision finale des juridictions étrangères concernées.
A défaut de notification de refus provisoire transmise à lOMPI dans le délai standard de douze ou de dix-huit mois selon les Conventions internationales ratifiées par les Etats dorigine, la protection est automatiquement acquise dans le pays concerné. A des fins dinformations, linstance nationale étrangère peut émettre une déclaration doctroi de la protection à lOMPI qui la publiera. Le demandeur recevra également sa copie.
Il existe un lien fort entre la marque internationale et la marque nationale déposée au préalable. Si dans un délai de cinq ans, pour quelque motif que ce soit, la marque française cesse de produire ses effets, la marque internationale cessera également de produire ses effets même si les conditions de protection de la marque à létranger se trouvaient remplies. La marque internationale sera radiée (et cette radiation sera publiée à la Gazette de lOMPI). Toutefois, le Protocole de Madrid offre une procédure de conversion des demandes. En effet, en cas de radiation, le titulaire peut déposer une demande denregistrement de la marque devant linstance nationale concernée dans un délai de trois mois à compter de la radiation. Le titulaire pourra ainsi se prévaloir de la date de lenregistrement international, comme date denregistrement dans le pays concerné. La protection est accordée pour un délai de dix ans, renouvelable indéfiniment. Le Bureau International envoie un rappel de renouvellement, six mois avant lexpiration de la protection. Lors du renouvellement, le titulaire peut limiter létendue géographique de la protection, il ne peut pas en revanche limiter sans radiation des classes de produits et/ou de services désignés lors du premier enregistrement international.
Le registre international est un moyen dinformation officiel de la vie de la marque, à destination des tiers. Ainsi, sur la demande du titulaire un certain nombre dinformations peuvent y figurer : modification des coordonnées, le changement de titulaire de lenregistrement, classes des produits et/ou services, renonciation pour certains pays Il nest pas possible de changer la marque lors du renouvellement.