Le traité de Lisbonne renforce la politique étrangère et de sécurité commune. On crée le Haut Représentant de lUnion pour les affaires étrangères et la politique de sécurité et le service européen daction extérieure. Lobjectif est de favoriser la cohérence dans la politique extérieure de lUnion européenne. Le Conseil vote à la majorité qualifiée et le Parlement européen a un pouvoir de codécision.
On inscrit une clause de défense mutuelle et une clause de solidarité. La première prévoit que lorsquun Etat membre est victime dune agression, les autres doivent lui apporter assistance. La seconde précise que lUnion européenne et les Etats membres en particulier doivent apporter une assistance à un Etat qui est victime dune catastrophe humaine ou naturelle ou dactes terroristes.
On reconnaît lexistence de lAgence européenne de défense et on met en place le principe de la « coopération structurée constante ». Sont concernés les Etats qui participeront aux programmes européens déquipement militaire et qui fourniront des forces de combat à lUnion européenne.
Certaines règles vont être harmonisées (par exemple, le traitement des demandes dasile) et dautres vont être adoptées pour définir les infractions et les sanctions des crimes transfrontaliers (par exemple, le terrorisme, le blanchiment dargent, le trafic darmes, le trafic de drogue, ). On prévoit de mettre en place un « système intégré de gestion des frontières extérieures » et de renforcer les pouvoirs de lAgence de surveillance des frontières de lUnion européenne, Frontex.
On reconnait le rôle et lexistence de lOffice européen de police, Europol. On renforce la coopération dans les domaines civil et pénal : obtention des preuves, accès à la justice, exécution des décisions, . Cest le principe de la reconnaissance mutuelle. Enfin, on étend les domaines de compétences de lUnion européenne. Elle a la possibilité dagir dans la lutte contre le terrorisme, la prévention des conflits,