A la reprise du travail, le salarié qui a eu un arrêt de travail de plus de 21 jours, doit se rendre à un examen médical. Il permet de vérifier laptitude ou non du salarié à reprendre son ancien emploi. Il met fin à la suspension du contrat de travail. Le salarié doit retrouver son poste aux conditions antérieures. Sil est déclaré apte par le médecin du travail, il retrouve son précédent poste. Dans le cas où il nexisterait plus ou quil serait occupé, il pourra être réintégré dans un emploi équivalent avec le même niveau de rémunération et de qualifications. Parfois, lavis daptitude sera assorti de réserves et le médecin demandera des modifications du poste de travail ou de lorganisation du travail. Lemployeur engage sa responsabilité lorsquil norganise pas la visite de reprise.
Le salarié peut reprendre son travail à temps partiel pour motif thérapeutique pendant une durée maximale d'un an. Il doit obtenir lautorisation du médecin traitant ou du médecin qui a prescrit le premier arrêt de travail. Le service médical de la Caisse primaire dassurance maladie (CPAM) doit donner son accord. Le médecin traitant fixe le pourcentage d'activité et le salarié et lemployeur déterminent les modalités du travail (la répartition des heures de travail dans la semaine notamment). Le salaire correspond au travail effectué. Il peut être complété par des indemnités journalières. Les situations sont examinées au cas par cas.
La maladie ne peut justifier un licenciement ou une sanction que si le salarié est déclaré inapte par le médecin du travail. Néanmoins, si lemployé est souvent ou fréquemment absent pour cause de maladie, le contrat de travail pourra être rompu. Il faut que les absences soient de nature à perturber la bonne marche de lentreprise et quelles rendent nécessaires le remplacement définitif du salarié. Beaucoup de conventions collectives fixent un délai de protection pendant lequel il est interdit de licencier pour une absence prolongée pour maladie. Sil souhaite remplacer le salarié absent, lemployeur a la possibilité de faire appel à une personne embauchée sous contrat à durée déterminée ou à un intérimaire. Par ailleurs, il faut noter que pendant larrêt de travail, lemployeur garde toujours la possibilité de licencier pour un autre motif que la maladie. Par exemple, une suppression demploi suite à une restructuration économique, une faute du salarié.